00397865
Univerzita Komenského v Bratislave
Šafárikovo nám. 6, Bratislava, 81499, SVK
48174068
VIAGENE s.r.o.
Slnečná 91, Bobrov, 02942, SVK
Reagencie na uskutočnenie NGS panelu
onkogény, nádorové ochorenia, chemikálie
Tovar, Služba
1. Reagencie na uskutočnenie NGS panelu
|
|
---|---|
Funkcia |
1. Kit možňuje analýzu 111 génov, ktoré sú spojené s rôznymi formami dedičných onkologických ochorení ako rakoviny prsníkov, rakoviny vaječníkov, rakoviny čriev, na analýzu familiárnej adenomatóznej polypózy, hamartomatóznej polypózy, juvenilnej polypózy, Peutzov-Jeghersovho syndrómu, Cowdenovho syndrómu, Bannayan-Riley-Ruvalcaba syndrómu, Fanconiho anémie a analýzu rakoviny endokrinných tkanív. Kit umožňuje prípravu knižnice za menej ako 9 hodín. Požadované vstupné množstvo genomickej DNA k vykonaniu analýzy 50 ng a menej; |
Kit musí mať interoperabilný index umožňujúci kombináciu s viacerými NGS analýzami GeneSG© na plaforme Illumina. Kit je CE-IVD validovaný na MiSeq, HiSeq a NextSeq prístroji. Kit obsahuje reagencie k príprave 12 vzoriek ako aj unikátny šifrovaný kľúč k bioanalýze 12 vzoriek cez online platformu s možnosťou vizualizácie cez CE-IVD nástroj GeneSystems© a možnosťou personalizovanej filtrácie dát. Požadované doručenie bioanalýzy do 48 hodín od odoslania raw dát na GeneSystems©. Bioinformatická analýza musí vychádzať z aktuálnej verzie genómu Hg38; |
Výsledky analýz jednotlivých vzoriek DNA musia poskytovať minimálne pokrytie cieľových génov 200x, pričom sa vylučuje čítanie mimo cieľových génov tzv. „off targets“ a čítanie zodpovedajúce duplicitám PCR, ktoré by mohli zvýšiť počet falošne pozitívnych výsledkov. Zároveň požadujeme aby sondy použité pri NGS analýze mali dĺžku 120nt, k zabezpečeniu čo najšpecifickejšej hybridizácie počas NGS analýzy. Kit musí spĺňať podmienky ISO13485 a AENOR certifikácie pod číslom GS-0001/2015. Kvalita SG-LV3658. |
2. Minimálny zoznam génov, ktoré je možné detegovať pomocou kitu: ACD, AIP, APC, ATM, ATR, AXIN2, BAP1, BARD1, BLM, BMPR1A, BRCA1, BRCA2, BRIP1, BUB1, CDH1, CDK4, CDKN1B, CDKN2A, CHEK2, DDB2, DICER1, DIS3L2, DKC1, ELANE, EPAS1, EPCAM, ERCC1, ERCC2, ERCC3, ERCC4, ERCC5, ERCC6, FANCA, FANCB, FANCC, FANCD2, FANCE, FANCF, FANCG, FANCI, FANCL, FANCM, FH, FLCN, G6PC3, GFI1, GREM1, HOXB13, JAGN1, KIF1B, KIT, MAX, MDH2, MEN1, MET, MITF; |
MLH1, MNX1, MSH2, MSH6, MSR1, MUTYH, NBN, NF2, NFIX, NHP2, NOP10, NSD1, NTHL1, PALB2, PARN, PDGFRA, PMS1, POLD1, POLE, POLH, POT1, PRKAR1A, PTCH1, PTEN, RAD50, RAD51, RAD51C, RAD51D, RB1, RECQL, RECQL4, RET, RTEL1, SCG5, SLX4 SMAD4, SMARCA4, STK11, SUFU, TERC, TERT, TINF2, TMEM127, TP53, TSC1, TSC2, UBE2T, VHL, VPS45, WAS, WRN, WT1, XPA, XPC, XRCC2. |
3. Kit obsahuje v prvom separátnom balení: GeneSGKit Tagmentation buffer (280 ul), GeneSGKit Tagmentation Enzyme (33 ul), GeneSGKit 5xPCR buffer (330 ul), GeneSGKit PCR enzyme (30 ul), GeneSGKit dNTPs (17 ul), GeneSGKit Primer Mix (17 ul), DMSO (50 ul), Onco-GeneSGKit Probes (26 ul), GeneSGKit Hybridization Buffer (90 ul), GeneSGKit Blocker Mix (75 ul), GeneSGKit RNase Block (8 ul), GeneSGKit P7 indexing primer (1-12) (5 ul z každého); |
GeneSGKit P5 indexing primer (13-20) (5 ul z každého), GeneSGKit Read Primer 1 (50 ul), GeneSGKit Read Primer 2 (50 ul) GeneSGKit Index Read Primer (50 ul). Skladuje sa pri -20°C. Kit obsahuje v druhom separátnom balení: GeneSGKit Stop Solution (450 ul), GeneSGKit Binding Buffer (11 ml), GeneSGKit Wash Buffer 1 (5 ml), GeneSGKit Wash Buffer 2 (10 ml). Skladuje sa pri izbovej teplote. |
Technické vlastnosti |
Jed |
Mi |
Ma |
Pres |
NGS reagenčný balík | bal. | 12 vzoriek |
Názov |
Vrátane dopravy na miesto plnenia |
Doručenie spracovaných analýz do 21 dní od prijatia vzoriek do laboratória. |
Objednávateľ pripúšťa ekvivalent v prípade preukázania, že sa jedná o plnohodnotný ekvivalent pre identické použitie v zmysle funkčnej špecifikácie a obvyklej praxe použitia špecifikovanej služby, požadovanej kompatibility a to bez potreby ďalších vyvolaných nákladov odberateľa. |
Objednávateľ požaduje predložiť vlastný návrh na plnenie predmetnej služby spolu s technickou špecifikáciou do 5 pracovných dní od uzatvorenia zmluvy. |
Predložená technická špecifikácia musí byť minimálne v takom rozsahu, aby bolo možné posúdiť či je predmet plnenia, ktorý chce dodávateľ dodať, v zhode so zmluvnými požiadavkami objednávateľa. |
Nedodržanie ktorejkoľvek podmienky a požiadavky objednávateľa uvedenej v Opisnom formulári sa bude považovať za podstatné porušenie zmluvných podmienok. |
Fakturácia bude v slovenskom jazyku (prílohou je dodací list). |
Splatnosť faktúry je 30 dní od jej predloženia a odsúhlasenia objednávateľom. |
Preddavok sa neposkytuje. |
Predmet zákazky bude uhrádzaný bezhotovostným prevodom na základe faktúry. |
Navrhovaná cena musí zahŕňať všetky náklady spojené s poskytnutím služby. |
Objednávateľ požaduje kompletne pokrytú službu. |
JLF UK, BIOMED, Divízia Onkológia, Malá hora 11161/4C, 03601 Martin, Martin, Martin, Žilinský, Slovenská republika
03.12.2018 10:00 — 19.12.2018 14:00
1,00 Kompletný predmet zákazky
2 970,00
Názov | Merná jednotka | Výhodnejšia hodnota | Váha |
---|---|---|---|
Cena bez DPH | € | Menšia | 100 |
22.11.2018 14:41
28.11.2018 09:00
28.11.2018 09:15
20 min.
2 min.
Dátum predloženia | Hodnota | MJ | Kritérium |
---|---|---|---|
22.11.2018 16:16 - Vstupná ponuka | 2 970,00 | € | Cena bez DPH |
22.11.2018 16:16 - Najvýhodnejšia ponuka | 2 970,00 | € | Cena bez DPH |
Vážený používateľ,
v súvislosti s povinnosťou elektronizácie verejného obstarávania od 18.10.2018 a zároveň s cieľom vylepšenia používateľského komfortu sme pre vás pripravili novú verziu systému EKS, ktorá so sebou prináša: